基于公共衛(wèi)生的考慮，而對嬰兒實施包皮環(huán)切術(shù)值得商榷。比如在美國，一般民眾會將嬰兒割包皮視為常態(tài)性的醫(yī)療行為，但澳洲、加拿大、美國的醫(yī)學團體并不建議常規(guī)性實施嬰兒包皮手術(shù)。縱使包皮環(huán)切術(shù)所導致的并發(fā)癥比率相當?shù)?，但少?shù)手術(shù)失誤、術(shù)后出血或術(shù)后感染可能引起的悲慘后果，卻不可忽視。美國小兒科醫(yī)學會建議應該對嬰兒的父母說明包皮手術(shù)相關的好處與風險。倡導包皮環(huán)切術(shù)的一方主張這是一項公共衛(wèi)生工程，能預防包皮感染，也可能有助于減緩愛滋病的散播；但生殖器健全運動等團體則認為這是侵犯人權(quán)的行為，甚至構(gòu)成一種性侵害，因此主張不應鼓勵，甚至應該禁止嬰幼兒接受包皮環(huán)切術(shù)。
知情同意
包皮環(huán)切術(shù)對一個男童而言，其醫(yī)療效益飽受爭議，往往非出于自愿，將來長大后若反悔也恐怕無法恢復原狀。因此監(jiān)護人是否有權(quán)為男童做出決定，以及這決定權(quán)如何界定，至今仍爭議不止。
從人權(quán)角度來講，新生兒包皮環(huán)切術(shù)不尊重孩子的權(quán)利，在孩子還沒有自主決定意識的時候，將父母親的意識強加于孩子身上。父母親通常會認為新生兒包皮環(huán)切術(shù)相對成年后手術(shù)痛苦較小，但有研究表明包皮環(huán)切術(shù)所致的疼痛甚至會影響到孩子對免疫接種的反應。特別是對于那些沒有手術(shù)指征的孩子，手術(shù)帶來的疼痛及可能的并發(fā)癥也許會帶來嚴重的后果。總之，新生兒是否該行包皮環(huán)切術(shù)不僅僅是個醫(yī)學問題，還涉及到文化、倫理、心理、宗教等多個方面。這也反映出，醫(yī)學認識的對象即人體、生命、健康、疾病等具有復雜性， 使許多問題一時還不能取得完整深刻的科學認識，認識主體的局限性與認識客體的無限性矛盾決定了認識過程的反復循環(huán)性。關于新生兒包皮環(huán)切的爭論仍在繼續(xù)，醫(yī)生要不帶偏見地把手術(shù)的利弊兩方面因素都提供給新生兒父母，讓他們自己仔細權(quán)衡后再做決定。
有人認為幼年受到包皮環(huán)切術(shù)的記憶可能在心靈留下傷痕，因此主張應該等年齡夠大、心智夠成熟時，再讓這位男性自己決定是否手術(shù)。
對情緒的影響
男性割包皮所受的情緒沖擊比較少受到重視。幾乎所有在嬰兒期割過包皮的成年男子表述，其并不認為在未麻醉的情況下割包皮為殘忍的行為，因為根本不可能會對手術(shù)有任何記憶。有關兒童人權(quán)的議題常受到忽視，就像包皮環(huán)切術(shù)可能使部分男性受到身心的傷害，卻往往被忽略。
在美國，大部分的新生兒包皮環(huán)切術(shù)都沒有用麻醉藥。
合法性
主要的醫(yī)學會均認為包莖環(huán)切術(shù)只要由法定監(jiān)護人同意，并簽署知情同意書，合法性就不成問題。
